がん診療連携・相談部門では、徳島県がん診療連携協議会や拠点病院と連携し、がん診療に携わる医療機関の医療機能の分化や連携、地域連携クリティカルパスの活用に向けて、主導的な役割を果たしています。
また、その他にも地域の病院との診療連携推進、患者の療養上に関する相談の対応をしています。